在伊拉克占多数的什叶派认定袭击者来自少数族群逊尼派阵营。许多什叶派人士发誓对此报复，仅周四一天，伊拉克各地就有至少130人被打死，其中多数为逊尼派。为防止局势失控，当局宣布多个地区进入紧急状态，总统塔拉巴尼更对什叶派和逊尼派之间的冲突可能导致全国性内战提出警告。

冲突由来已久

同属伊斯兰的什叶派和逊尼派之间的冲突原有其历史背景。北非和包括伊朗在内的中、近东地区的五分之一人口属于什叶派，而且只是在4个国家中占人口多数。它们分别是：伊朗，占85％；也门，占75％；以及伊拉克和巴林，均占60％。穆斯林世界的其它国家中，逊尼派是多数。

与基督教的各教派不同，什叶派和逊尼派之间的区别要大得多，原因是，两派之间在诸多问题上的态度可说是泾渭分明，势不两立。最早的分岐起于对先知继承人的分岐。穆罕默德先知于632年逝世后，阿里.巴克尔被挑选为第一任哈里发（伊斯兰教中所规定的宗教与世俗最高领袖）。尽管以后不断出现各哈里发之间的冲突，但哈里.巴克尔继承者这条线始终被认为是伊斯兰最重要的分支，这一分支起先在大马士革，以后在巴格达以及萨迈拉等地掌握统治权。

而根据什叶派的传统说法，穆罕默德在其逝世前不久曾交给其堂弟兼女婿阿里一项任务，即：领导穆斯林。虽然阿里仅被选为第4任哈里发，对什叶派而言，他却是首位“伊马目”。什叶派视伊马目为宗教最高领袖。而在逊尼派那里，只要某人的才学足以使他有能力主持共同礼拜，这个人就可以拥有伊马目头衔。

在逊尼派眼里，阿里是一个弱主。不过，两派最初在不否认阿里具备世俗权威合法性这一点上并无二致。然而，不久之后，事情骤然起变。穆斯林内部出现冲突和分裂。阿里被褫夺哈里发称号，而他的继承人又得不到阿里支持者们的承认。这派人称自己为“什叶阿里”，意为阿里派，这就是后世所知的什叶派。

公元661年，阿里被人杀害。他的各代继承人是伊马目们，受到什叶派的拥护，一直传至第11代伊马目－哈桑.阿尔.阿斯卡里。阿斯卡里及其父、第10代伊马目便被安葬在萨迈拉清真寺。随着阿斯卡里的去世，与先知穆罕默德相连接的基本清晰的承继链条也告结束。阿斯卡里的儿子穆罕默德.马赫迪还在孩提时代便已消失，那是9世纪。从那以来，什叶派信众一直在期待着这位12代伊马目的归来，其情形犹如犹太人和基督徒对救世主“弥赛亚”的期盼。

在逊尼派那里，数百年来，尽管存在着各位哈里发后来相互竞斗的局面，但“哈里发”始终具有重要意义。虽然巴格达的哈里发国家结构一度被蒙古人所取消，但这一结构在奥斯曼帝国却一直延续到1924年。

从16世纪以降，什叶派伊斯兰一直是伊朗的国教。但是，什叶派最重要的圣地－第三、第七、第九、第十及第十一代伊马目的陵墓却都位于西部邻国伊拉克。而伊拉克的历史变幻近代多端，时而是逊尼派成为统治者，时而又由来自伊朗的什叶派掌控权力。虽然逊尼派占少数，但近代以来，伊拉克却基本处于这一派的控制之下。独裁者萨达姆.候赛因时代亦不例外。不过，随着萨达姆的被推翻，在伊拉克占多数的什叶派的势力已日见增长。