在前不久北京召开的人大会议上，中国总理温家宝发表政府工作报告，其中提到台湾的前途要由两岸人民共同决定。有记者问陈主委对此作何评价。陈明通表示百分之百的不同意：“台湾的未来只能由台湾的两千三百万人来决定。如果不是这样，那么台湾现在选举总统，难道也要由13亿人来投票吗？这是民主最基本的道理。至于未来两岸关系怎么走，我们可以来谈判，提出方案，北京提出一国两制，我们不同意。我们也提出了方案。讨论的结果我们也要交由人民决定。至于他们怎么办，是否听人民的意见，那是他们家的事情。”

陈明通表示愿意与北京政府谈判，与中共和解，但谈判结果也要问台湾老百姓是否同意。他指责北京方面在谈判时常常是“把魔鬼藏在细节里”：“比如大陆观光客来台湾，大陆非要加上中国大陆居民赴中国台湾旅游。那我们怎么能接受呢？因为中国就是中华人民共和国嘛。我们希望把这个架构移除掉，到台湾来就到台湾来玩就好了，干吗去考虑是国际旅游还是国内旅游，就像我当时去中国旅游，我也没有想是去国内还是去国外。玩就是玩嘛。Just do it。”

陈明通劝告大陆方面在处理两岸关系时要宁拙勿巧，不要机关算尽。由观光客自然谈到两岸直航。陈明通表示，不管谁当选他都对近期内就直航达成一致表示乐观：“现在进行中的三项议题谈判，客运包机，货运包机，观光，技术上的问题我们都谈完了，都有共识了。但北京不放，是有政治考量。因为现在放了，等于是给了民进党信誉。他们不愿在选举之前帮民进党的忙。”

他声称，如果他能在陆委会主委的位置上作下去，只需要一年左右的时间就能实现直航。陈明通在批评北京方面有政治考量的同时，也承认目前两岸交流频繁，大陆也越来越务实，不一定碰“一中”的话题。

记者会上另一个不断涉及的话题是公投。陈对公投低调处理。他说，公投只是表达台湾人民加入联合国的意愿，既不是改国号，也不是修宪。如果公投通过，希望国际社会关注北京的一举一动。不过，照目前形势看来，公投通过的可能微乎其微。