爆炸案发生的当晚，伦敦的一家阿拉伯语报纸(英文名称：AL-Quds Al-Arabi)主编阿特万对英国“天空新闻”电视台和BBC说，该报收到一封以基地组织名义发来的阿拉伯语电子邮件。这封电子邮件称，基地组织认为西班牙是“反伊斯兰战争联盟”的最主要成员之一，该组织的“死亡命令”击中了反伊斯兰十字军联盟的先锋，从而清算了与西班牙的一笔帐。

西班牙政府表示将仔细地审查该信的真伪。内务大臣安赫尔.阿塞韦斯说，西班牙警方正在进行全方位调查，而巴斯克民族分裂组织“埃塔”仍是最大的嫌疑犯，因为爆炸中使用的炸药是“埃塔”组织所惯用的；另外，“埃塔”组织在去年圣诞节期间曾声言要制造火车爆炸事件。本来，爆炸事件刚发生后，阿塞韦斯曾将“基地”或其它伊斯兰组织排除在嫌疑目标之外。

阿塞韦斯今天还透露，西班牙警方找到了一辆被报失的送货车，车上搜查出七根雷管和一盘录有古兰经内容的阿拉伯语录音带。不过，录音带上并没有威胁要进行恐怖袭击的内容。

中欧时间今天上午，西班牙警方还发现了一枚炸弹并及时解除了其引爆装置，这枚炸弹藏在从爆炸现场集中到马德里警察局的一堆行李里。当时，一个提包里传出的手机铃声引起了警察的警觉，他们怀疑这一手机信号可能是用来引爆炸弹。显然，这枚炸弹的引爆机制出现了故障，否则会有不少警察局工作人员成为爆炸的牺牲品。

据最新的统计，爆炸事件造成的死亡人数已经上升到198，受伤人数达1500多。爆炸事件中，共有10枚炸弹在三个地点差不多同时被引爆。警方在事发地点的旅客行李中还发现了三枚没有被引爆的炸弹，这三枚炸弹被设定成晚些时候形成第二波爆炸，其目的显然是要在救援人员中造成伤亡。

西班牙政府宣布进行三天的举国哀悼。国王胡安.卡洛斯号召西班牙人团结一致与恐怖主义作斗争，称“恐怖主义绝不会达到它的目的”。西班牙首相阿斯纳尔在内阁紧急会议后宣布，西班牙不会向恐怖主义屈服，不会与恐怖组织讨价还价，并一定会彻底战胜恐怖分子。

本周日，西班牙将举行议会大选，现任首相阿斯纳尔此前早已宣布不再参加竞选谋求连任。来自执政党保守派阵营的前副首相拉霍伊被认为是最有希望的候选人，而他的最强有力对手则是工人社会党的候选人萨帕特罗。