对于特别费案一审获判无罪，马英九14日召开记者会，除感谢和他一起奋斗半年的律师朋友，也谈及个人的感受。马英九说，这半年来，他自己感到相当悲愤，但仍旧期待司法的公正。

马英九强调，自己未来一定要为台湾的清廉和正义继续打拼，这个案子攸关全国数万名现在在职以及卸任的首长，在特别费案件审理的过程中，法官对特别费的设计和历史沿革，包括客观的属性以及当事人的主观认知，法院都做了详细的认知和交代，是一个有里程碑的高度判决。

马英九说，在审判的过程中，侦查中引发争议的动作，也引发关注，这在判决书中，也都有所交代。马英九说，这应该不是他才有的待遇，他相信，一定也有其他的人，也遭致类似的待遇，像是先以关系人传唤然后改列被告等。马英九认为，这些问题都和人权保障相关，不可以忽视，必要时要推动法律修正。

马英九在今年二月原本遭检方依贪污治罪条例中，涉嫌利用职务上之机会诈取财物罪起诉，审理中，检方还认为马英九涉嫌公务背信罪。不过案件经过台北地方法院四个月审理后，台北地方法院表示，马英九以领据领取特别费既没有施用诈术也没有使任何人陷于错误，加上法院审酌特别费的缘起和实务运作的情况后，也认为特别费具有实质补贴性质，因此判决马英九无罪。

马英九特别费官司一审宣判无罪，民进党与台联党都表示并不意外，他们痛批司法已死、法院是国民党开的；而率先检举本案的民进党籍立委谢欣霓不满表示，法院将单纯司法案件当成政治案件来审判，她认为法官把“特别费视为实质补贴”的见解，质疑有政治力介入司法。

马英九的特别费案获判无罪，替马英九的总统之路扫除了阴霾，泛蓝阵营士气大振。对此，陈水扁总统表示，这还不是最后确定的结果，但重要的是民进党不能够利用别人的犯错来得利，而是民进党必须要让人民感动，而且也必须内部先做好团结，推出胜选的组合。